Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab11fip3Q8CHD8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab11fip3Q8CHD8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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Rab11fip3Q8CHD8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab11fip3Q8CHD8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Rab11fip3Q8CHD8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Rab11fip3Q8CHD8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Rab11fip3Q8CHD8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Rab11fip3Q8CHD8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Rab11fip3Q8CHD8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms