Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Usp27Q8CEG8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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