Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Amigo3Q8C2S7 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Amigo3Q8C2S7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Amigo3Q8C2S7 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Amigo3Q8C2S7 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Amigo3Q8C2S7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Amigo3Q8C2S7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Amigo3Q8C2S7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Amigo3Q8C2S7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Amigo3Q8C2S7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Amigo3Q8C2S7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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