Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ctdsp2Q8BX07 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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