Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubash3bQ8BGG7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms