Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms