Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ttc29Q80VM3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ttc29Q80VM3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ttc29Q80VM3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ttc29Q80VM3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc29Q80VM3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms