Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clec18aQ7TSQ1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms