Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prrc2bQ7TPM1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc2bQ7TPM1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms