Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Uhrf2Q7TMI3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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