Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tpm4Q6IRU2 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms