Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ParpbpQ6IRT3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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