Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt40Q6IFX3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt40Q6IFX3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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