Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Clcn1Q64347 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clcn1Q64347 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms