Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sema3cQ62181 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sema3cQ62181 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sema3cQ62181 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sema3cQ62181 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sema3cQ62181 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms