Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VcanQ62059 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
VcanQ62059 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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VcanQ62059 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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VcanQ62059 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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VcanQ62059 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VcanQ62059 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VcanQ62059 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VcanQ62059 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VcanQ62059 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VcanQ62059 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VcanQ62059 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VcanQ62059 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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