Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm11546-201ENSMUST00000120297 354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm7158-201ENSMUST00000120079 903 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ncor1Q60974 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms