Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprnQ60673 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms