Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

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Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trpm3Q5F4S9 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trpm3Q5F4S9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trpm3Q5F4S9 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trpm3Q5F4S9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trpm3Q5F4S9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpm3Q5F4S9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpm3Q5F4S9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpm3Q5F4S9 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpm3Q5F4S9 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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