Protein–RNA interactions for Protein: Q3V4B5

Commd6, COMM domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd6Q3V4B5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd6Q3V4B5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Commd6Q3V4B5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms