Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms