Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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BB287469Q3UT53 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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BB287469Q3UT53 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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BB287469Q3UT53 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BB287469Q3UT53 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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