Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Q3U6N9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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