Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Traf3ip1Q149C2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Traf3ip1Q149C2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms