Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc162pQ0VG85 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc162pQ0VG85 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc162pQ0VG85 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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