Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Itgb8Q0VBD0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms