Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms