Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
MestQ07646 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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MestQ07646 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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MestQ07646 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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MestQ07646 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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MestQ07646 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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MestQ07646 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MestQ07646 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms