Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gdf3Q07104 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf3Q07104 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms