Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nme2Q01768 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.1 ms