Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SeleQ00690 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms