Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itga4Q00651 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itga4Q00651 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Itga4Q00651 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Itga4Q00651 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Itga4Q00651 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itga4Q00651 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Itga4Q00651 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms