Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AlkP97793 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AlkP97793 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AlkP97793 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AlkP97793 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AlkP97793 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms