Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkp1P97350 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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