Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Irx1P81068 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms