Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx3P81067 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Irx3P81067 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx3P81067 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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