Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Acta1P68134 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms