Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Copz1P61924 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms