Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nphp4P59240 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms