Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn18P56857 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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