Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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LtbrP50284 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbrP50284 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbrP50284 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LtbrP50284 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbrP50284 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbrP50284 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbrP50284 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbrP50284 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LtbrP50284 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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