Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms