Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Saa4P31532 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Saa4P31532 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -1
Saa4P31532 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Saa4P31532 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Saa4P31532 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Saa4P31532 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Saa4P31532 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Saa4P31532 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Saa4P31532 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Saa4P31532 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Saa4P31532 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Saa4P31532 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Saa4P31532 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms