Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms