Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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