Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PdgfaP20033 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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