Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sdc1P18828 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms