Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18530 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
P18530 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
P18530 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms