Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl9P18340 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.3 ms