Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Thsd1-202ENSMUST00000160585 3276 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm12408-206ENSMUST00000211577 1983 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms